Lammps入门手册

如果力场参数出现在将要读取的文件中,则这些命令会告诉LAMMPS使用哪种力场: pair_style , bond_style , angle_style , dihedral_style , improper_style 。 在LAMMPS中定义原子的方式有3种。通过 read_data 或 read_restart 命令从数据中读取它们或重新启动文件。这些文件可以包含

lammps教程:run命令使用技巧,多次run正确写法

再如run N start N1 stop N2，表示从N1到N2步数内，运算N步。这适用于特定步数区间内的模拟。类似用法还包括运行N步，每隔N1步执行一次特定命令。例如，共运行6000步，每2000步在屏幕上输出一行提示。以上是run命令的简单介绍。更多详细用法请参考lammps官方手册。

简单安装:通过CMake安装LAMMPS

安装准备：在拥有CentOS系统，且预装了openmpi、fftw等基础依赖的环境下，你需要从lammps官网下载lammps-stable.tar.gz安装包，以及CMake版本3.10以上。构建过程：解压lammps包后，进入文件夹，创建名为build的子目录。在build内，使用CMake进行配置，它会检测并启用MPI、OpenMP等支持。配置完成后，你会看到...

lammps教程:in文件结构详解以及一个比较实用的in文件模板

在in文件中，命令按照编写顺序执行，大多数情况下，命令执行顺序影响不大，但涉及依赖参数的命令则需确保参数定义和计算在执行前完成。例如，使用fix deform命令拉伸晶体时，应变速率代码需位于命令行前。lammps提供了丰富多样的命令，官方手册长达两千多页，但多数研究领域常用的命令仅数十个。掌握这数十个...

Ubuntu 安装LAMMPS软件

1. 安装基础包 打开终端，依次输入：2. 下载安装包 打开终端，依次输入：下载fftw-3.3.8.tar.gz 下载mpich-3.3.2.tar.gz 下载lammps-stable.tar.gz （提示：链接是copy大佬的，我使用的也是fftw3.38与mpich3.32版本，安装包一直保存着）3. 安装fftw 打开终端，依次输入：4. 安装mpich 打开...

lammps中文手册 恒定应力怎么模拟

三角函数是以角度（数学上最常用弧度制，下同）为自变量，角度对应任意角终边与单位圆交点坐标或其比值为因变量的函数。也可以等价地用与单位圆有关的各种线段的长度来定义。三角函数在研究三角形和圆等几何形状的性质时有重要作用，也是研究周期性现象的基础数学工具。在数学分析中，三角函数也被定义为...

软件部署第三弹-Lammps在linux系统部署安装

LAMMPS，即大型原子\/分子大规模并行模拟器，是由美国Sandia国家实验室开发的一款经典分子动力学代码。它主要用于模拟气体、液体和固体状态下粒子的集合行为，能够处理全原子、聚合物、生物、金属、粒状和粗粒化体系。本次文章旨在提供高效可用的安装部署方法，对使用Linux系统以及刚接触科学计算类软件的用户十分...

没有输出,再好的lammps模拟也没用:dump命令4种用法

首先，对于初学者而言，dump atom是最简单易用的选项。只需每100步输出一次所有原子坐标，文件名自定义，如dump.atom。文件内容仅含原子类型和坐标信息。对于更个性化的输出，dump custom允许用户自定义输出内容，如原子ID、类型、速度和受力等。只需要在命令后直接列出所需信息即可，如“atomid type x y...

Lammps从原理到实践(1):Lammps基本原理

一、计算原理 分子动力学假定粒子在经典牛顿力学框架下移动，每个时间点内可计算原子位置、速度和加速度，迭代更新原子位置，得到整体运动轨迹。牛顿力学和势函数 经典牛顿力学计算公式简单，作用力为矢量。在分子动力学中，通过计算原子间对力得到作用力，具有微观仿真特性。分子动力学使用势函数描述原子间作用...

lammps 怎么控制恒温层温度

可以用NVT系综——正则系综，原子数、体积、温度不变，定义保持温度T不变。也可以采用其他的系综，见于manual手册里面，定义fix里面。