LAMMPS命令解读系列--解读fix langevin 命令

fix langevin命令是分子动力学模拟软件LAMMPS中用于控制温度和阻尼参数的重要命令。以下是关于fix langevin命令的详细解读：命令功能：fix langevin命令通过引入朗之万热浴来维持系统的正确温度，特别适用于系统时间尺度远短于周围流体分子时间尺度的情况。在朗之万热浴中，系统内的粒子同时受到随机力和粘性力的作用，这两种力的相互作用

lammps教程:reset_timestep步数归零的作用以及使用方法

作用： 步数归零：reset_timestep命令的主要作用是将当前模拟的步数重置为指定的步数，从而在某些模拟场景下使步数计算更加方便。 方便计算：在某些模拟中，如摩擦模拟，摩擦球的运动距离可通过模拟步数乘以步长和运动速度来计算。此时，将步数重置为零可以简化计算过程。使用方法： 命令语法：reset_timestep ...

LAMMPS—region命令解析

LAMMPS中的region命令用于定义空间几何区域，以下是该命令的详细解析：基本功能：定义空间几何区域：region命令可以在LAMMPS模拟中定义一个特定的空间几何区域。与其他命令交互：该区域可以与create_atoms、create_box、group、delete_atoms等命令交互。区域边界与原子归属：包含边界原子：当检测原子位置是否在区域...

LAMMPS运行和语法

通过安装VSCode插件“Lammps Syntax Highlighting”，代码高亮功能得以实现。在Settings - Text Editor - Files - Asscociations中添加两行，以实现更佳的代码提示功能。效果显著，鼠标悬停在命令上即显示帮助文档，体验非常贴心。参考LAMMPS中文站和Lennard-Jones fluid - (lammpstutorials.github.io)。小案例...

lammps教程:run命令使用技巧,多次run正确写法

run命令在lammps模拟中不可或缺，主要用于设定运算步数并启动运算。run命令的基本形式是run N，表示运行N步。这是最常用的用法。另外，run命令还有更高级的应用。例如，run 0，虽然看似与run N形式相似，但其功能独特，即在不启动积分运算的情况下，计算热力学信息。此功能常用于热力学变量的初始化。运...

LAMMPS—region命令解析

region命令在LAMMPS中用于定义空间几何区域，它与许多其他命令交互，比如在定义区域中创建原子（create_atoms）、定义模拟盒子（create_box）、将原子定义为一组（group）、删除定义区域中的原子（delete_atoms）、将区域的表面定义为壁面（fix wall\/region）等。使用region命令时，需要检测原子位置是否在区域...

LAMMPS运行和语法

LAMMPS语法：注释：使用#符号进行注释。命令与参数：命令名称为小写，参数可以是大写或包含字母和表达式。字符串：支持单引号、双引号和三引号字符串。换行：在命令末尾使用&符号表示该命令未结束，后续内容将在下一行继续。变量与表达式：$符号有三种用途，表示变量、立即解释数学表达式、用于格式化字符串。脚...

LAMMPS中的系综(fix langevin)命令

在LAMMPS中，通过使用`fix langevin\/kk`命令可以实现加速模拟，这主要应用于系综控制，以模拟粒子与隐式溶剂的作用。使用`fix nve`命令进行布朗动力学模拟时，粒子受到的力由两个部分组成：保守力项和摩擦阻力项。保守力项由`pair_style dpd\/tstat`命令实现，在粒子力场作用基础上添加热力学项。摩擦阻力...

lammps教程:reset_timestep步数归零的作用以及使用方法

在lammps模拟中，我们经常使用reset_timestep命令来调整模拟步数。在默认情况下，模拟步数是累加计算的，从模拟开始一直持续到结束。例如，Cu融化过程包括能量最小化阶段和npt升温过程，最小化阶段运行了53步，npt升温从第53步开始，到1053步结束。然而，在某些情况下，我们可能需要模拟步数从零开始计数，...

LAMMPS 学习笔记之 variable 命令

Variable 命令在 LAMMPS 中用于创建变量，并允许在脚本中引用这些变量。使用时，需要提供变量名（由字母和下划线组成）和风格（共计17种），之后的参数依据所选风格而定。字符串可以是文本、其他变量或表达式，类似于编程语言中的函数。语法格式为 variable name style args ...。此命令的实例包括：在后续...